《Nat Commun》:HDAC9-MALAT1-BRG1復合物介導胸主動脈瘤平滑肌功能障礙
BACKGROUND INTRODUCTION
在不同的外界因素影響下,血管平滑肌(vascular smooth muscle cell,VSMCs)具有不同的細胞表型,具有極強的可塑性。正常血管中膜中的VSMCs是一種高分化的細胞,主要起維持血管形態以及收縮血管的作用,具有低增殖、低遷移、低蛋白分泌的特征;當血管病變時VSMCs可以去分化成為未分化的細胞,細胞收縮性能下降,表現高增殖、高遷移、高蛋白分泌等特征。有研究發現,組蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9,HDAC9)基因座的人類序列變異與諸如大血管缺血性中風、心肌梗塞、顱內動脈瘤和主動脈鈣化等血管疾病相關,這表明HDAC9與心血管疾病有著密切的關系。
2018年,哈佛醫學院Christian L. Lino Cardenas等人,在《Nature Communications》雜志(IF2017=12.353,綜合性期刊1區)發表了題為“An HDAC9-MALAT1-BRG1 complex mediates smooth muscle dysfunction in thoracic aortic Aneurysm”的文章。
所用到的主要方法
METHODS
1.RNA敲低實驗
2.劃痕實驗
3.微陣列
4.免疫印跡
5.RT-PCR
6.免疫沉淀(Co-IP):以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎,用于研究蛋白質間相互作用的經典方法,是確定兩種蛋白質在完整細胞內生理性相互作用的有效方法。
7.酶譜法(Zymography):基于SDS-PAGE電泳和反相凝膠染色的蛋白酶檢測方法,本文用于檢測MMP-2、MMP-9活性。
8.熒光原位雜交技術(Fluorescence in situ hybridization, FISH):如果被檢測的染色體或DNA纖維切片上的靶DNA與所用的核酸探針是同源互補的,二者經變性-退火-復性,即可形成靶DNA與核酸探針的雜交體。
9.染色質免疫共沉淀(ChIP):在保持組蛋白和DNA聯合的同時,通過運用對應于一個特定組蛋白標記的生物抗體,染色質被切成很小的片斷,并沉淀下來。
10.CLIP-seq (crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing):紫外交聯免疫沉淀結合高通量測序,可以高通量研究RNA結合蛋白在體內與眾多RNA靶標的結合模式,并揭示其在一些重要生物學過程中的功能,是一項在全基因組水平揭示RNA分子與RNA結合蛋白相互作用的新技術。
ABSTRACT
胸主動脈瘤(TAA)與影響TGF-β信號傳導途徑成員的突變,或者影響血管平滑肌細胞(VSMC)肌動蛋白細胞骨架成分及調節因子的突變有關。雖然這兩種不同突變在臨床上都表現出相似的表型,但其潛在的共同發病機制仍然時不清楚的。本文研究發現:影響TGF-β信號傳導和VSMC細胞骨架的突變都會導致形成三元復合物,這個三元復合物包括組蛋白去乙酰化酶HDAC9、染色質重塑酶BRG1和長非編碼RNA MALAT1。這種HDAC9-MALAT1-BRG1復合物會結合到染色質上,并抑制收縮蛋白基因表達,同時引起組蛋白H3-賴氨酸27三甲基化修飾增加。而Malat1或Hdac9的破壞則會恢復收縮蛋白表達,改善主動脈壁結構,并抑制實驗性動脈瘤的生長。 因此,本研究證實:在兩種不同形式胸主動脈瘤(TAA)中,血管平滑肌細胞(VSMC)功能障礙有著共同的表觀遺傳通路,這對其他已知的HDAC9相關的血管疾病也具有潛在的治療意義。

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