強強聯合,北京智源人工智能研究院與晶泰科技攜手組織藥物AI大賽
2020年1月,北京智源人工智能研究院聯合專注于AI驅動藥物研發的科技企業晶泰科技,以及數據評測平臺biendata,共同發布了AI與制藥的數據比賽“智源小分子化合物性質預測挑戰賽”,總獎金10萬元。
藥物研發是一項成本極高的工作。著名的醫學期刊《美國醫學會雜志》(JAMA)的一篇調查論文顯示,研發一款癌癥藥物的成本在6.48億美元左右。其中,大量成本都會用于待選藥物分子的生物、化學測試實驗上。虛擬篩選等計算技術可以縮小篩選對象集,降低制藥成本,但是需要消耗較多的計算資源。如何利用已有數據建立優質的機器學習模型,逼近真實結果,將為虛擬藥物設計找到準確度和成本的平衡點。化學信息學和機器學習在藥物研發中的應用已經有一定的歷史,在最近以深度學習為前沿的AI潮流下,行業正在探索更廣泛的人工智能技術在藥物發現中的應用。
本次比賽的目的正是讓最新的人工智能算法推動新藥研發。本次比賽的數據包括13萬個小分子的3177個特征,比賽要求選手根據這些特征預測六個與藥物開發息息相關的化學性質,例如室溫下的原子化能、偶極矩和最高占據分子軌道能等。
競賽希望提出一種機器學習模型,根據小分子結構特征預測小分子的物理化學性質。這種預測方法可以協助研究機構和制藥企業對大量待選分子進行快速篩選,集中人力和物力研究被機器學習模型選中的分子集合。
與同類競賽和同類研究相比,本次比賽的數據集有以下幾個特點:
1) 這個數據集的特點是相比于通常的生物化學數據集,數據量大;
2) 同時該數據集來源于量化計算結果,數據一致性好;
3)該數據集上的屬性預測和藥物研發中需要考慮的屬性存在緊密關聯,在該數據集上獲得的算法經驗將有可能直接用于真實研發場景。
在此次比賽同期,北京智源人工智能研究院還同步發布了多個科研與應用數據集。北京智源人工智能研究院副院長、清華大學計算機系教授唐杰表示:“本次智源的數據算法大賽,一方面促進了數據共享,提升數據使用效率,另一方面以賽代訓,提升了廣大學生和工程人員的技術水平,很有意義。”
本次比賽的主辦方是北京智源人工智能研究院(Beijing Academy of Artificial Intelligence,BAAI)。智源研究院是落實“北京智源行動計劃”的重要舉措,在科技部和北京市委市政府的指導和支持下,由北京市科委和海淀區政府推動成立,是依托北京大學、清華大學、中國科學院、百度、小米、字節跳動、美團點評、曠視科技等北京人工智能領域優勢單位共建的新型研發機構。在 2018 年 11 月 14 日舉行的 2018 中國(北京)跨國技術轉移大會開幕式上,智源研究院正式揭牌。
晶泰科技(XtalPi)是一家以計算驅動創新的藥物研發科技公司,基于前沿計算物理、量子化學、人工智能與云計算技術,為全球創新藥企提供智能化藥物研發服務。我們希望通過提高藥物研發關鍵環節的效率與成功率、降低研發成本,為患者帶來更多優質的藥物。晶泰科技創立于麻省理工學院(MIT)校園,核心團隊由來自學術界、IT互聯網界及醫藥產業界的優秀人才組成。晶泰科技已經成功為來自美國、歐洲、中國、日本的40余家先鋒藥企提供了藥物研發服務。
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