華為云助力新冠病毒基因自動化鑒定云平臺上線
2月10日，由中國科學院上海營養與健康研究所、中國科學院上海巴斯德研究所共同開發，由華為云提供技術支撐的新冠病毒基因組自動化鑒定平臺（Virus Identification Cloud, VIC）正式上線，將推動疫情的診治與防控，大幅提高診斷效率。
如何精準高效地診斷病人是否感染新型冠狀病毒，是當前防控工作的關鍵問題。國家衛健委發布的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案（試行第五版）》，對鑒別診斷要求，“單從臨床表現、胸部影像學難以鑒別，需依靠病原學檢測來區分。”
基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學證據之一，是病毒朔源、變異進化、致病機理等研究的基礎性工作，在疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計等工作中也發揮著不可替代的基礎性的作用，與國家衛健委要求高度契合。
圖：病毒采樣與分析流程
VIC平臺直接對接二代基因測序原始數據，具有對數據全自動質量控制、拼接和病毒組成分析等功能，實現了快速檢測樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內的各種病毒，并在線分析其相對載量，基于分析結果，精準識別病毒基因特性，監測病毒變異趨勢，為后續的疫苗與藥物研發提供數據支撐。
VIC平臺實現了從病毒組基因組測序到基因組拼接與鑒定的“一鍵式”自動化服務，極大簡化了操作流程。各醫院只需上傳病例原始數據至云端，即可觸發自動化的病毒基因分析流程，并獲得該病例的全基因組分析結果。
華為云容器為VIC平臺提供了自動化測序分析引擎和強大的算力，支持高通量多樣本云端并行分析。分析結果不僅能為全面分析研究患者的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐，還可以幫助醫院進行臨床診斷，為采用相應的治療措施提供參考，同時還可監測病毒變異趨勢，便于醫院各界提前做出應對措施。
圖：VIC分析流程
目前，上海市公共衛生臨床中心，上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院、中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院作為平臺的首批用戶，已在VIC上完成了批量新型冠狀病毒肺炎患者樣本的基因組原始測序數據分析。
圖：序列物種分布餅圖
據悉，在疫情結束前，VIC面向科研用戶免費開放。
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